一、在法院办理协议离婚是怎么回事
《婚姻法》第三十一条规定：“男女双方自愿离婚的，准予离婚”，是指协议离婚。包括在民政局婚姻登记机关申请离婚登记，由民政局颁发离婚证解除婚姻关系和在法院由法庭调解达成离婚协议，法院作出离婚裁定两种情况。这两种情况的法律结果都是解除了法定的婚姻关系。
实践中，我国人员流动情况非常突出，男女双方可能均不在户口所在地生活和工作也是普遍现象，比如，男女双方户口分别在新疆和黑龙江，但人却分别在北京或上海工作，如果按一般思路，双方去民政局办理协议离婚，就只能回新疆或黑龙江户籍所在地民政局婚姻登记机关办理，因路途遥远并不现实。而其实协议离婚不仅仅是在民政局办理，也可以在一方住所地或经常居住地法院办理 。
如果双方符合了协议离婚的条件，而回户口所在地办理离婚手续交通费用和时间成本较高的话，不如通过诉讼方式调解离婚，诉讼成本也很低，比如在北京、上海，大多数基层人民法院都设有速裁庭、简易法庭或称便民法庭，对此这类案件若文书齐全、操作得当，当天就可以办理完毕，诉讼费最低只为50元。只不过法院出具的不是离婚证，而是民事调解书。民事调解书一经签订即产生同判决书同等法律效力，而且从某种程度上说，民事调解书的效力要较离婚证更高，一方不履行调解书内容，对方可直接申请法院强制执行。因此在法院调解离婚是现代都市男女不错的选择。
二、协议离婚有哪些缺点
1、从协议的履行方面来看，民政局协议离婚所备案的离婚协议书虽然有效，但是不具有强制执行的效力，当一方不履行协议内容时，另一方必须向法院另行起诉解决，而协议书中所约定的内容，并不是百分之百得到法律的支持。一旦产生纠纷，仍需法院判决，具有很大的不确定性。通过法院达成的调解协议离婚，有法院下达的调解书，具有可强制执行的效力。任何一方不履行法院的调解协议，对方即可向法院申请强制执行，法院通过查封、冻结、甚至拘留罚款等强制措施使对方必须遵守协议，更有保障。
2、从协议内容来看，民政局对于离婚协议的内容基本不审查，由双方当事人协商一致就可以，因此，协议书中涉及对财产、子女、债权债务的处分，往往是根据当事人对法律的认识，措词不规范，考虑不周全，极易产生纠纷，留下隐患。 而法院协议离婚，经过律师、法官的层层把关，调解书的每一条款都会逐条进行审查，合法、严谨，并确保今后可供强制执行，没有隐患，更彻底的解决问题。
基本上，民政协议离婚的优点是省时省钱，但一旦产生纠纷，仍需再次诉讼。而法院调解离婚虽成本较高，但优点是有强制执行依据，没有再次纠纷的可能性，一次性根本解决问题。在我们办理的案件中，有三成比例的案件是来自离婚后纠纷，原因多是一方不遵守协议，不履行义务；或是离婚协议本身制定时就有缺陷，如约定不明双方有争议，只得再次提起诉讼。因此，如果当事人不是必须立即办理离婚，对必要的经济支出有能力承受，有共同财产需要分割、有子女需要约定抚养及探视权，符合以上情形的，建议应当在法院协议离婚，对双方权利、义务都是一种保障，这一点对保护妇女儿童等弱势群体更为重要。
